L'avènement de l'Association des compagnies aériennes africaines (AFRAA) est la résultante d'événements historiques et d'impératifs économiques.

L'origine conceptuelle de l'AFRAA remonte à 1963 lorsque quelques compagnies aériennes africaines, saisissant l'occasion de l'Assemblée Générale Annuelle de l'IATA, prirent l'initiative de tenir des réunions de concertation afin de débattre des problèmes qui leur étaient spécifiques et d'adopter des positions communes. Ce fut le premier pas vers la création de la future AFRAA.

De ce premier pas franchi à Rome en 1963, les démarches de 14 compagnies  aériennes africaines débouchèrent sur la création à Accra en 1968, d'une organisation régionale servant de cadre à la formulation des points de vue de la région et à la promotion de la coopération entre entreprises de transport aérien.

La première Assemblée générale eut lieu en février 1969 au Caire, en Egypte. Entre autres décisions prises, elle adopta les Statuts de l'Association.

Un regard rétrospectif sur les activités menées par l'Association au fil des 37 dernières années permet à l'AFRAA d'affirmer en toute modestie:

1. qu' elle a été à l'avant-garde de toutes les initiatives majeures prises dans le domaine du transport aérien en Afrique, en vue de sensibiliser les compagnies aériennes africaines sur la nécessité de coopérer entre elles dans les domaines du commercial, du technique, de l’exploitation des vols et de la formation. 

2. qu'elle a joué un rôle capital pour sensibiliser les gouvernements africains, en tandem avec la Commission Africaine de l'Aviation Civile et d'autres organisations régionales et sous-régionales, sur les actions à mener s’ils veulent développer en Afrique un système de transport aérien sûr et efficace.  Elle a joué un rôle de catalyseur pour faire adopter toutes les mesures importantes du continent.